Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDIT3P35638 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDIT3P35638 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms