Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms