Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTPRAP18433 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTPRAP18433 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTPRAP18433 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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PTPRAP18433 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRAP18433 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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