Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME1P15531 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms