Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms