Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL18O94889 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms