Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms