Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms