Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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