Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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