Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HCN3Q9P1Z3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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