Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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