Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms