Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms