Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms