Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms