Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms