Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBPQ99417 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms