Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNAQ96QF7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms