Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms