Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDAC11Q96DB2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms