Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms