Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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