Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CPVL-203ENST00000409850 2213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC130365.1-201ENST00000530524 1553 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LINC01959-201ENST00000508452 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ARMC2-203ENST00000392644 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MEF2C-203ENST00000437473 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MAGED1-203ENST00000375722 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC073263.2-201ENST00000624835 1863 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CLEC4F-202ENST00000426626 2012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PRAMEF1-201ENST00000332296 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SLC11A2-209ENST00000547198 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ATL1-201ENST00000358385 2647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 POTED-201ENST00000299443 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 SLC35A5-207ENST00000494706 840 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 STPG1-201ENST00000003583 2544 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 KIAA1024L-201ENST00000564719 2354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SVIPQ8NHG7 SPRTN-204ENST00000391858 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 494 ms