Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms