Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ52

CHPF, Chondroitin sulfate synthase 2, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPFQ8IZ52 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHPFQ8IZ52 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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