Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC1Q7Z7K0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms