Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED27Q6P2C8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms