Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms