Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NANOGP8Q6NSW7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NANOGP8Q6NSW7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NANOGP8Q6NSW7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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