Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms