Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms