Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms