Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms