Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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