Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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