Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP7Q16576 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms