Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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