Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms