Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms