Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TAF11Q15544 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TAF11Q15544 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TAF11Q15544 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TAF11Q15544 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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