Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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NCAPHQ15003 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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NCAPHQ15003 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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NCAPHQ15003 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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NCAPHQ15003 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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NCAPHQ15003 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCAPHQ15003 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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