Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms