Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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