Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR4Q13639 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms