Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms