Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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