Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms