Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNA1Q09470 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms