Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD51Q06609 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms